पहले हाइपरलूप परीक्षण के अपने वादे से कम होने के कई कारण हैं। सबसे पहले, बुनियादी ढांचा। तकनीक को व्यवहार्य बनाने के लिए, किसी भी हाइपरलूप प्रणाली को व्यापक बुनियादी ढांचे की आवश्यकता होती है-और ऐसा निर्माण जिसमें बहुत पैसा खर्च होता है। इलेक्ट्रिक कारों के किसी भी बड़े पैमाने पर कार्यान्वयन को उसी बाधा का सामना करना पड़ेगा। इलेक्ट्रिक वाहनों के लिए चार्जिंग स्टेशनों के साथ यह कितना मुश्किल है, लेकिन हाइपरलूप के साथ लागत काफी अधिक होगी। शहरी क्षेत्रों में भूमिगत मार्ग समस्याग्रस्त हो सकते हैं, इसलिए भूमिगत होने की आवश्यकता होगी, जिससे लागत और बढ़ जाएगी।
पूर्ण-स्तरीय हाइपरलूप के लिए एक अन्य तकनीकी चुनौती हाइपरलूप प्रणाली के भीतर निर्वात को बनाए रखना है, क्योंकि कोई भी वायु रिसाव फली की अधिकतम गति को प्रभावित करेगा। वैक्यूम को बनाए रखने के लिए पूरे मार्ग में समय-समय पर बड़े वैक्यूम पंप लगाने होंगे और इन्हें संचालित करने की आवश्यकता होगी। लेकिन एक सौ या इतने मील लंबे निर्वात या निकट-निर्वात कक्ष का निर्माण लगभग असंभव है। वर्तमान में चेक गणराज्य में इंस्टीट्यूट ऑफ ऑर्गेनिक केमिस्ट्री एंड बायोकेमिस्ट्री में एक ब्रिटिश वैज्ञानिक ने कहा कि दो मुख्य समस्याएं एक सीधी नली और वायुमंडलीय दबाव पर विस्तार के मुद्दे हैं।